台權會建議立法院應對違法的公務機關採取罰鍰，並加上針對違法且未依規定改正的機關採取暫時禁止蒐用的禁制令，以及刪除違法所得個資的命令，才能有效降低公務機關系統性違法帶來的損害。在委員身分上，為維持個資會獨立性，也不應從其他機關遴選。